Пет дана кодирања, геномике и фармакогеномике окупило је 36 младих истраживача у Сплиту на првој летњој школи биоинформатике InnoThyroGen.
Прва летња школа биоинформатике InnoThyroGen одржана је од 1. до 5. септембра 2025. године у Медитеранском институту за науке о животу (MedILS) у Сплиту. Као део пројекта Horizon Europe InnoThyroGen, догађај је окупио 36 учесника, укључујући студенте, докторанде и постдокторске истраживаче.
Организатори су осмислили програм који комбинује теорију са праксом. Овај приступ је учесницима пружио прилику да ојачају своје рачунарске вештине и одмах их примене у истраживању геномике и фармакогеномике.
Увод: Летња школа биоинформатике InnoThyroGen 2025. у Сплиту
Летња школа била је прва од три планирана догађаја у оквиру пројекта InnoThyroGen. Током пет дана, учесници су стекли увид у биоинформатичке алате, кодирање, геномске токове рада и примене фармакогеномике.
Дан 1: Основе Пајтона и вештачка интелигенција у кодирању
Летња школа је отворена поздравним говорима Андрее Гелемановић (MedILS UNIST и MEFST) и Николе Котура (IMGGE). Након тога, Николина Плеић (MEFST) је представила пројекат InnoThyroGen.
Касније је Новак Мартиновић (Персида) представио основе програмирања у Пајтону, а Петар Кекез (Sharp Agency) објаснио како вештачка интелигенција подржава кодирање. Први дан је остао више теоретски, што је помогло учесницима да се постепено припреме за интензивне дане који су пред њима.
Дан 2: Практични рад са Пајтоном, обрада природног језика и велики језички модели
Другог дана, учесници су провели цео програм на кодирању у Пајтону. Невена Вучинић и Новак Мартиновић (Персида) водили су их кроз практичне вежбе.
Поред тога, сесије су истраживале обраду природног језика (NLP) и велике језичке моделе (LLM) за биомедицинска истраживања. Интензивно кодирање је било захтевно. Међутим, такође је постало једно од најистакнутијих делова Летње школе.
Дан 3: Анализа геномских података и обука за Linux
Среда је померила фокус на геномске токове рада. Бранка Зукић (IMGGE) представила је ток рада секвенцирања следеће генерације. Након њене сесије, Невена Вучинић (Персида) је представила анализу геномских података помоћу NextFlow-а.
Штавише, Биљана Станковић (IMGGE) одржала је популарно предавање о основама Linux-а. Поподне је Ђорђе Павловић (IMGGE) водио практичне сесије о мапирању сирових очитавања и откривању варијанти, које су учесници сматрали изузетно корисним.
Дан 4: Фармакогеномски алати и практичне примене
Четвртак је био фокусиран на фармакогеномику (PGx). Бранислава Гемовић (C4IR) објаснила је геномске репозиторијуме, а затим је Никола Котур (IMGGE) представио PGx базе података и биоинформатичке алате. Касније је Марина Јеловац (IMGGE) представила популациону фармакогеномику.
Поподне је Марина Јеловац такође демонстрирала алат Stargazer. Након тога су Биљана Станковић и Никола Котур представили алат PharmCAT. Обе сесије су се истакле по својим практичним применама.
Дан 5: Анотација варијанти, HLA типизација и будуће вештине
Последњи дан је почео са Ивом Саболић (Labena), која је представила анотацију варијанти. Затим се
Завршне речи Андрее Гелемановић и Николе Котура привеле су програм крају. Њихове поруке су нагласиле важност сарадње и континуираног учења.
Тимски рад и умрежавање на Летњој школи
Током целе недеље, учесници су се међусобно подржавали током вежби. Као резултат, тимски рад је постао дефинишућа карактеристика догађаја.
Било је јасно да, иако је теорија пружила основу, учесници су преферирали практичне сесије. Ове активности су им омогућиле да директно примене знање, што је одржавало висок ниво ангажованости.
Поглед у будућност: Још летњих школа из биоинформатике и фармакогеномике
Успех прве летње школе InnoThyroGen потврдио је вредност комбиновања рачунарске обуке са биомедицинским истраживањима.
Организатори се захваљују свим учесницима на њиховој посвећености и свим предавачима на њиховим доприносима. Ово је била прва од три планиране летње школе у оквиру пројекта InnoThyroGen.
Следећа издања ће се надоградити на овај замах и понудити нове могућности младим истраживачима да ојачају своје вештине у биоинформатици и фармакогеномици.
📢 Останите у току са ажурирањима, пратите наше канале и не пропустите прилику да се придружите следећој летњој школи InnoThyroGen!
