Od 8. do 12. septembra 2026., projekat InnoThyroGen održao je svoju 2. letnju školu na Institutu za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo (IMGGE) u Beogradu, Srbija.
Tokom pet dana, učesnici su istraživali ključne metode i alate koji se koriste u humanoj genetici i studijama asocijacije na nivou celog genoma (GWAS). Program je kombinovao predavanja, praktične kompjuterske radionice, pozvana predavanja, grupne diskusije i interaktivne sesije.
Letnja škola je postepeno prelazila sa fundamentalnih statističkih i računarskih veština na napredne genomske analize. Učesnici su radili sa alatima i metodama koje se koriste u modernim genetičkim istraživanjima i imali su mnogo prilika da razgovaraju o svom radu sa predavačima i drugim učesnicima.
Dan 1 – Postavljanje temelja
Letnja škola je počela sa sesijom dobrodošlice i upoznavanja učesnika, koja je predstavila program i pružila učesnicima priliku da se međusobno upoznaju.
Prva predavanja su se fokusirala na statističke osnove potrebne za genetičke studije. Nikolina Pleić je predstavila ključne statističke koncepte kroz dvodelno predavanje Uvod u statistiku za genetičke studije.
Popodne su učesnici prešli sa teorije na praktičan rad. Andrea Gelemanović je vodila dve kompjuterske radionice o Linux-u. Sesije su obuhvatile kako osnovnu, tako i napredniju upotrebu Linux-a i pripremile učesnike za računarski rad planiran za naredne dane.
Dan 2 – Humana genetika, GWAS i R
Drugi dan je učesnike upoznao sa humanom genetikom i studijama asocijacije na nivou celog genoma.
Andrea Gelemanović je otvorila dan predavanjem Uvod u humanu genetiku i GWAS. Nikolina Pleić je zatim nastavila sa dve sesije o Statističkim modelima za GWAS.
Učesnici su takođe ojačali svoje praktične veštine analize podataka. Tokom dve kompjuterske radionice, Andrea Gelemanović je predstavila R, od početnog podešavanja i tipova podataka do manipulacije i vizualizacije podataka.
Dan je završen grupnom diskusijom o Otvorenoj nauci, etici i metodološkim zamkama u GWAS-u. Sesija je podstakla učesnike da sagledaju šire metodološke i istraživačke izazove, izvan tehničke analize.
Dan 3 – Kontrola kvaliteta i populaciona struktura
Treći dan je bio fokusiran na važne korake koje istraživači preduzimaju pre i tokom GWAS analiza.
Nakon pozvanog predavanja Lennarta C. Karssena (PolyOmica, Holandija), Andrea Gelemanović je učesnike upoznala sa Kontrolom kvaliteta za GWAS. Učesnici su zatim primenili ove koncepte tokom praktične radionice koristeći PLINK 2.0.
Popodne je bilo fokusirano na populacionu strukturu. Nikolina Pleić je prvo predstavila temu kroz predavanje, a zatim je vodila učesnike kroz praktičnu radionicu PLINK 2.0.
Dan je zaključen predavanjem o Analizi asocijacije, pripremajući učesnike za naprednije analize četvrtog dana.
Dan 4 – Od analize asocijacije do funkcionalne anotacije
Četvrti dan je nastavljen sa naprednim GWAS metodama i njihovom praktičnom primenom.
Program je počeo pozvanim predavanjem Maksima Frejdina (King’s College London, Ujedinjeno Kraljevstvo). Učesnici su zatim radili na Analizi asocijacije koristeći PLINK 2.0 i GEMMA pod vođstvom Nikoline Pleić.
Sledeća kompjuterska radionica bila je fokusirana na Funkcionalnu anotaciju. Učesnici su istraživali nekoliko široko korišćenih alata i resursa, uključujući COLOC, FUMA, GTEx i LocusZoom.
Popodne su pozvani članovi učestvovali u InnoThyroGen R&I laboratoriji. U međuvremenu, učesnici Letnje škole imali su priliku da istraže Beograd kroz vođenu turu grada.
Dan 5 – Poligeni skorovi rizika i napredna genomika
Poslednji dan je okupio nekoliko naprednih pristupa u genetičkim istraživanjima.
Andrea Gelemanović je započela program praktičnom radionicom o meta-analizi koristeći METAL. Nakon toga, Lucija Buljac je predstavila koncept Poligenih skorova rizika (PRS).
Učesnici su zatim primenili ovo znanje u praksi tokom kompjuterske radionice o PRS-u koristeći SBayesR i SBayesRC.
Završno predavanje, koje su vodile Andrea Gelemanović i Nikolina Pleić, istraživalo je Napredne genomske pristupe, uključujući mašinsko učenje i Mendelovu randomizaciju.
Letnja škola je zaključena sesijom pitanja i odgovora, povratnim informacijama o kursu i zatvaranjem, pružajući učesnicima i predavačima poslednju priliku za razmenu ideja i osvrt na petodnevni program.
Pet dana učenja i saradnje
Druga letnja škola InnoThyroGen kombinovala je teorijsko znanje sa praktičnim iskustvom. Učesnici su razvili veštine iz statistike, Linux-a, R-a, GWAS-a, kontrole kvaliteta, populacione strukture, analize asocijacije, funkcionalne anotacije, meta-analize i Poligenih skorova rizika.
Jednako važno, Letnja škola je stvorila prostor za diskusiju, razmenu znanja i saradnju među istraživačima zainteresovanim za genetiku i genomiku.
Kroz aktivnosti kao što je Letnja škola, InnoThyroGen nastavlja da jača istraživačke kapacitete i razmenu znanja u genomici i personalizovanoj medicini.
📢 Pratite nas za novosti, pratite naše kanale i ne propustite priliku da se pridružite sledećoj Letnjoj školi InnoThyroGen!
FOTO
