Od 8. do 12. rujna 2026., projekt InnoThyroGen održao je svoju 2. ljetnu školu na Institutu za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo (IMGGE) u Beogradu, Srbija.
Tijekom pet dana, sudionici su istraživali ključne metode i alate koji se koriste u ljudskoj genetici i studijama asocijacije na razini cijelog genoma (GWAS). Program je kombinirao predavanja, praktične računalne radionice, pozvana predavanja, grupne rasprave i interaktivne sesije.
Ljetna škola postupno je prelazila s temeljnih statističkih i računalnih vještina na napredne genomske analize. Sudionici su radili s alatima i metodama koje se koriste u modernim genetičkim istraživanjima i imali su mnogo prilika za raspravu o svom radu s predavačima i drugim sudionicima.
1. dan – Izgradnja temelja
Ljetna škola započela je sesijom dobrodošlice i upoznavanja sudionika, koja je predstavila program i pružila sudionicima priliku da se međusobno upoznaju.
Prva predavanja bila su usmjerena na statističke osnove potrebne za genetičke studije. Nikolina Pleić predstavila je ključne statističke koncepte kroz dvodijelno predavanje Uvod u statistiku za genetičke studije.
Poslijepodne su sudionici prešli s teorije na praktičan rad. Andrea Gelemanović vodila je dvije računalne radionice o Linuxu. Sesije su pokrile osnovno i naprednije korištenje Linuxa te su pripremile sudionike za računalni rad planiran za sljedeće dane.
2. dan – Ljudska genetika, GWAS i R
2. dan upoznao je sudionike s ljudskom genetikom i studijama asocijacije na razini cijelog genoma.
Andrea Gelemanović otvorila je dan s Uvodom u ljudsku genetiku i GWAS. Nikolina Pleić zatim je nastavila s dvije sesije o Statističkim modelima za GWAS.
Sudionici su također ojačali svoje praktične vještine analize podataka. Tijekom dvije računalne radionice, Andrea Gelemanović predstavila je R, od početnog postavljanja i tipova podataka do manipulacije i vizualizacije podataka.
Dan je završio grupnom raspravom o otvorenoj znanosti, etici i metodološkim zamkama u GWAS-u. Sesija je potaknula sudionike da gledaju izvan tehničke analize i razmotre šire metodološke i istraživačke izazove.
3. dan – Kontrola kvalitete i populacijska struktura
Treći dan bio je usmjeren na važne korake koje istraživači provode prije i tijekom GWAS analiza.
Nakon pozvanog predavanja Lennarta C. Karssena (PolyOmica, Nizozemska), Andrea Gelemanović upoznala je sudionike s kontrolom kvalitete za GWAS. Sudionici su zatim primijenili te koncepte tijekom praktične radionice koristeći PLINK 2.0.
Poslijepodne je bilo usmjereno na populacijsku strukturu. Nikolina Pleić prvo je predstavila temu kroz predavanje, a zatim je vodila sudionike kroz praktičnu radionicu PLINK 2.0.
Dan je zaključen predavanjem o analizi asocijacija, pripremajući sudionike za naprednije analize 4. dana.
4. dan – Od analize asocijacija do funkcionalne anotacije
4. dan nastavljen je s naprednim GWAS metodama i njihovom praktičnom primjenom.
Program je započeo pozvanim predavanjem Maxima Freydina (King’s College London, Ujedinjeno Kraljevstvo). Sudionici su zatim radili na analizi asocijacija koristeći PLINK 2.0 i GEMMA pod vodstvom Nikoline Pleić.
Sljedeća računalna radionica bila je usmjerena na funkcionalnu anotaciju. Sudionici su istraživali nekoliko široko korištenih alata i resursa, uključujući COLOC, FUMA, GTEx i LocusZoom.
Poslijepodne su pozvani članovi sudjelovali u InnoThyroGen R&I laboratoriju. U međuvremenu, sudionici Ljetne škole imali su priliku istražiti Beograd kroz vođeni obilazak grada.
5. dan – Poligeni rezultati rizika i napredna genomika
Posljednji dan okupio je nekoliko naprednih pristupa u genetičkim istraživanjima.
Andrea Gelemanović započela je program praktičnom radionicom o meta-analizi pomoću METAL-a. Nakon toga, Lucia Buljac predstavila je koncept poligenih rezultata rizika (PRS).
Sudionici su zatim primijenili to znanje u praksi tijekom računalne radionice o PRS-u koristeći SBayesR i SBayesRC.
Završno predavanje, koje su vodile Andrea Gelemanović i Nikolina Pleić, istraživalo je napredne genomske pristupe, uključujući strojno učenje i Mendelovu randomizaciju.
Ljetna škola zaključena je sesijom pitanja i odgovora, povratnim informacijama o tečaju i zatvaranjem, dajući sudionicima i predavačima posljednju priliku za razmjenu ideja i promišljanje o petodnevnom programu.
Pet dana učenja i suradnje
Druga ljetna škola InnoThyroGen kombinirala je teorijsko znanje s praktičnim iskustvom. Sudionici su razvili vještine u statistici, Linuxu, R-u, GWAS-u, kontroli kvalitete, populacijskoj strukturi, analizi asocijacija, funkcionalnoj anotaciji, meta-analizi i poligenim rezultatima rizika.
Jednako važno, Ljetna škola stvorila je prostor za raspravu, razmjenu znanja i suradnju među istraživačima zainteresiranima za genetiku i genomiku.
Kroz aktivnosti poput Ljetne škole, InnoThyroGen nastavlja jačati istraživačke kapacitete i razmjenu znanja u genomici i personaliziranoj medicini.
📢 Pratite nas za novosti, pratite naše kanale i ne propustite priliku pridružiti se sljedećoj InnoThyroGen ljetnoj školi!
FOTO
